Ubicado al norte de la Costa Brava, entre las poblaciones de Castelló d’Empúries, Empuriabrava y Sant Pere Pescador, este parque natural es el segundo más importante de Cataluña de estas características, ya que concentra un gran número de especies autóctonas de flora y fauna.

El Parque Natural de las Marismas del Empordà está dividido en dos grandes áreas, al norte y al sur del río Muga, que reúnen los elementos más característicos del paisaje de la comarca del Alt Empordà.